Reti pilota per le malattie rare : questi progetti pilota sono stati finanziati dal programma di sanità pubblica prima della definizione del quadro giuridico della direttiva sull’assistenza sanitaria transfrontaliera.

I progetti sulle reti di riferimento europee riportati di seguito sono stati allestiti nel quadro della direttiva sull'assistenza sanitaria transfrontaliera e hanno ricevuto finanziamenti dall'UE a titolo del programma per la salute , per contribuire all'attuazione della strategia dell'UE per la salute .

Dal 2005, l'Agenzia esecutiva per la salute e i consumatori gestisce gli inviti a presentare proposte di progetti e le sovvenzioni e si occupa delle conferenze e delle relazioni con i beneficiari dei finanziamenti del programma per la salute.