Europa-Kommissionens støtte kan opdeles i tre hovedområder: medfinansiering af projekter, støtte til oplysningsaktiviteter (især til EU-formandskabernes årlige e-sundhedskonferencer på højt plan ) samt oplysnings- og netværksstrukturer, udveksling af god praksis og politikudformning.
EU har været med til at finansiere en lang række e-sundhedsprojekter under forskellige programmer.